Du nævner selv array, selfom du nævner det på en lidt forkert måde.
Jeg vil tro din variabel er en string.
$data = "10,20,30,40,50,60";
den skal laves om til en array:
$array=explode(",",$data); //laver stringen om til array
Herefter kan du løbe hvert element igennem, og erstatte hvis det er noget bestemt
foreach($array as $key => $value){
if($value=="det der skal erstattes"){
$array[$key]="det der skal erstattes med";
}
}
Så kan du slutte med at lave din array om til en string igen:
$data=implode(",",$array);