Lige til sidst, så det er ikke nok at kunne php? 
Et eksempel kunne være at du gerne vil have en form for slideshow hvor billeder fader ud og fader frem i en bestemt rækkefølge og skifter billede efter 2 sekunder.
Du kan lave hele opsætningen i CSS med at ligge billederne ovenpå hinanden og via PHP kan du lave HTML'en som indsætter billeder.
Men selve animationen hvor billedernes style ændres i et bestemt tidsinterval skal laves via javascript.