jeg tvivler på det er muligt med andet end java applets at sætte deres parameters med client script - det kunne let være "farligt" at besøge en side så.
Men prøv med
setParam(<param_name>,<value>
ala:
<embed name="vid" ..../>
<a href="javascript:document.vid.setParam('fullscreen','true');window.alert('fullscreen');">
Alligevel ville jeg lave min egen lille flash afspiller, og smide den ind i et div, afspilleren skulle have bredde og højde på 100% og divet et fast, som så kunne sættes gennem javascript. Det er altid bedst at forsøge at holde brugeren på sin hjemmeside.